Le rivage de l’estuaire n’est pas tapissé que d’argile et de vase. Il dessine une mosaïque précieuse de zones humides, de roselières, de prairies halophiles, de vasières et de marais salés. Selon l’Inventaire National du Patrimoine Naturel, plus de 270 espèces d’oiseaux y ont été recensées au fil des années, dont certaines en danger comme la gorgebleue à miroir ou le busard des roseaux.
L’esturgeon européen (Acipenser sturio), poisson préhistorique aujourd’hui menacé d’extinction en Europe, trouve ici l’un des derniers sites de reproduction (source : INRAE). La lamproie marine, étrange poisson migrateur, remonte chaque année l’estuaire, tout comme l’alose ou le saumon atlantique. L’écosystème fonctionne comme le berceau, le refuge et le garde-manger d’espèces emblématiques de la faune aquatique.
- Plus de 150 espèces de poissons vivent ou transitent par l’estuaire (Préfecture de la Gironde).
- Des zones classées Natura 2000 protègent près de 70 000 hectares autour de l’estuaire.
Ainsi, toute altération de la qualité de l’eau, toute artificialisation, toute pollution, peuvent entraîner des conséquences en cascade sur cette toile fragile, nourrie du limon des rivières et du sel de l’Atlantique.